Notas biopoéticas 1 - 6

Biopoese (do grego bio, vida, + poiéo, produzir, fazer, criar), de onde o termo aqui deveria ser “biopoésicas”, como em “genésica”, o adjetivo do que se refere à geração, mas que também é equivalente a genético/genética.

Notemos que tudo se torna muito coerente, além de ser, como bem trata Asimov num certo  prefácio, “aquilo que chama-se estilo”, e logo, espero, soa bonito.

Um histórico: Desde que iniciei minha vida no aspecto “redes sociais”, muitas foram as vezes em que o tema tratado foi a origem da vida, e ao longo desses últimos anos, muitas vezes foram levantadas boas referências sobre diversos temas, noticiadas recentes descobertas, encontrados textos dignos de serem reproduzidos (e editados, como de costume) e até pinçadas boas citações.

Assim, com páginas e páginas anotadas, chegou a hora de começar a colocar tais notas numa forma de revisão, um tanto caótica, pelo menos à princípio, desculpem-me, mas esperando ser útil aos meus amigos “das biológicas” e todos os interessados.

Devem-se somar a estas notas os artigos, seguidamente mais sérios, estruturados e originais:

Diálogos sobre homoquiralidade com Silvia Gobbo - Parte 1 - Scientia

Diálogos sobre homoquiralidade com Silvia Gobbo - Parte 2 - Scientia

Homoquiralidade, origem, questões relacionadas e uma certa derrapada de famoso cientista - Scientia est Potentia

Peptídeos catalisadores e enantiosseletivos - Scientia est Potentia

Reconstructed ancient ocean reveals secrets about the origin of life - www.sciencedaily.com

1

“A natureza livre e desprovida de seus altivos senhores se vê como atriz espontânea de todas as coisas sem intervenção dos deuses.” – Lucrécio (Titus Lucretius Carus, ca. 99 a.C. – ca. 55 a.C.)

2

Independentemente da sua complexidade inicial, a vida com base química metabólica com auto-manutenção não poderia ter surgido na ausência de um mecanismo de replicação genética assegurando a manutenção, estabilidade e diversificação dos seus componentes. Na ausência de quaisquer mecanismos hereditários, as cadeias de reação autotróficas teriam ido e vindo sem deixar descendentes diretos capazes de ressuscitar o processo. A vida como a conhecemos consiste tanto de química e informações. Se a vida metabólica já existiu na Terra primitiva, para convertê-la para a vida como a conhecemos teria sido exigido o surgimento de algum tipo de sistema de informação em condições que seriam favoráveis à sobrevivência e manutenção de moléculas informativas genéticas.

"Evolution and functional limits of gene translation” presented by Lluís Ribas de Pouplana, IRB Barcelona - www.bio21.unimelb.edu.au

Outra referência do autor:

Lluis Ribas de Pouplana; The Genetic Code and the Origin of Life - www.google.com.br

3

Arturo Becerra, Luis Delaye, Sara Islas, and Antonio Lazcano; The Very Early Stages of Biological Evolution and the Nature of the Last Common Ancestor of the Three Major Cell Domains - isites.harvard.edu

Recentes estudos genômicos comparativos suportam o último modelo e propõem que o “ur-ancestral” foi semelhante aos organismos modernos em termos de conteúdo de genes.

( “Ur-ancestor” não possui muito direta tradução para o português, sendo, aproximadamente, um ancestral extremamente remoto, primordial, original.)

Resumo

As estimativas quantitativas do complemento genético do último antepassado comum de todos os organismos existentes, isto é, o “cenancestral”, podem ser impedidas por eventos de transferência de genes horizontais antigos e perdas de genes polifiléticos, bem como por vieses em bases de dados genômicas e artefatos metodológicos. No entanto, a maioria dos relatos concorda que o último antepassado comum se assemelhava a procariotas existentes. Um número significativo de genes altamente conservados são sequências envolvidas na síntese, degradação e ligação de RNA, incluindo transcrição e tradução. Embora o complemento gênico do cenancestor inclua sequências que podem ter se originado em diferentes épocas, a conservação extraordinária de sequências relacionadas ao RNA suporta a hipótese de que o último ancestral comum era um resultado evolutivo do chamado mundo RNA / proteína. A evidência disponível sugere que o “cenancestral” não era um hipertermófilo, mas atualmente não é possível avaliar seu nicho ecológico ou seu modo de aquisição de energia e fontes de carbono.

4

Estimativas teóricas do conteúdo genético do genoma do último ancestral comum sugerem que não era um “progenota” ou uma protocélula, mas uma entidade semelhante aos procariontes existentes.

Last Universal Common Ancestor had a complex cellular structure - news.illinois.edu

Artigo científico relacionado:

Manfredo J Seufferheld, Kyung Mo Kim, James Whitfield, Alejandro Valerio and Gustavo Caetano-Anollés; Evolution of Vacuolar Proton Pyrophosphatase Domains and Volutin Granules: Clues Into the Early Evolutionary Origin of the Acidocalcisomes; Biology Direct20116:50; DOI: 10.1186/1745-6150-6-50 - biologydirect.biomedcentral.com

Resumo

Os grânulos de Volutin parecem estar universalmente distribuídos e são morfologicamente e quimicamente idênticos aos acidocalcisomas, orgânulos granulares, densos em elétrons, ricos em cálcio e fosfato, cujas funções incluem armazenamento de fósforo e vários íons metálicos, metabolismo de polifosfato, manutenção do pH intracelular, osmorregulação e homeostase do cálcio. Pensa-se que os procariotas diferem dos eucariotas por não possuírem organelas membranares. No entanto, demonstrou-se que, como em acidocalcisomas, os "grânulos de volutina" intracelulares (corpos de polifosfato) intracelulares ricos em cálcio e polifosfato, em duas espécies bacterianas, Agrobacterium tumefaciens e Rhodospirillum rubrum, estão ligados à membrana e que as pirofosfatases vacuolares de translocação de prótons (V-H+PPases) estão presentes nas suas membranas circundantes. Os grânulos de Volutin e acidocalcisomas foram encontrados em organismos tão diversos como bactérias e seres humanos.

5

Seufferheld MJ, Caetano-Anollés G.; Phylogenomics supports a cellularly structured urancestor.; J Mol Microbiol Biotechnol. 2013;23(1-2):178-91. doi: 10.1159/000346552. Epub 2013 Apr 18. - www.ncbi.nlm.nih.gov

Resumo

Células e vírus são estruturados e abrigam organização complexa. Isso se manifesta em compartimentos intra e extracelulares, como retículos e espaços periplásmicos, organelas de armazenamento e de colheita de energia, como acidocalcisomas e mitocôndrias, e estruturas especializadas que mantêm repositórios genômicos como núcleos e cápsides. A reconstrução filogenômica estrutural do repertório de proteínas do antepassado comum da vida, o “urancestor”, sugere que essas entidades que existiam há 2,9 bilhões de anos não eram apenas complexas do ponto de vista estrutural e funcional, mas também estruturadas de forma celular. Também fornecemos suporte à existência de organelas “urântrales” de armazenamento que eram análogas aos acidocalcisomas. Estas estruturas celulares provavelmente acumularam compostos que armazenavam energia em suas ligações de fosfoanidrido, tais como polifosfatos. Esses compostos ricos em energia necessários para intermediários tioéster e pirofosfato teriam canalizado a abundante energia redox (reação de oxirredução) da Terra primitiva para as necessidades metabólicas precoce das células primordiais. Nossos achados são compatíveis com uma célula “urancestral” relativamente complexa e com abundante evidência de microfósseis que apoiam a existência de comunidades microbianas primordiais há 3,4 bilhões de anos atrás. Os resultados destacaram a centralidade do compartimento celular e bioenergética nos estágios evolutivos iniciais da vida

6

STANLEY MILLER ESTAVA CERTO – A SÍNTESE ABIÓTICA DE AMINOÁCIDOS, AUTO-CRISTALIZAÇÃO PRÉ-BIÓTICA E A QUEBRA DE SOLUÇÕES RACÊMICAS PARA A ORIGEM DA VIDA. - netnature.wordpress.com

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STANLEY MILLER ESTAVA CERTO - docs.google.com